鱖魚是我國重要的淡水優(yōu)質(zhì)魚類，也是我國漁業(yè)轉(zhuǎn)方式、調(diào)結(jié)構(gòu)的首選品種之一。解決鱖魚攝食活餌養(yǎng)殖成本高、生長速度下降、成活率低、病害頻發(fā)等問題成為鱖魚新品種培育的重要方向。因此，利用高效的現(xiàn)代分子育種技術(shù)，研發(fā)創(chuàng)制基因芯片，對開展鱖魚選育具有重要意義。

中國水產(chǎn)科學(xué)研究院珠江水產(chǎn)研究所鱖鱸基因組學(xué)與選擇育種創(chuàng)新團隊與華智生物技術(shù)有限公司合作，利用cGPS（Genotyping by Pinpoint Sequencing of captured targets）靶向測序技術(shù)，研發(fā)了具有自主知識產(chǎn)權(quán)的首個鱖魚40K液相育種芯片“鱖芯1號”。該芯片可應(yīng)用于鱖魚種質(zhì)資源鑒定、遺傳多樣性評估、基因定位與挖掘鑒定、全基因組關(guān)聯(lián)分析、分子輔助定向改良和智能育種等不同場景，為鱖魚遺傳研究和品種選育提供了高效基因型鑒定工具。利用該芯片可篩選獲得優(yōu)良性狀的鱖魚新品種，還將進一步降低選育成本，助力鱖魚全基因組選育和良種創(chuàng)新研究。

該芯片位點多態(tài)性高、基因組分布均勻，位點在染色體上的平均覆蓋率為99.87%，平均間距17Kb。性狀關(guān)聯(lián)位點豐富，芯片包括團隊前期研究篩選獲得的鱖魚馴食、性別和生長性狀關(guān)聯(lián)的分子標記554個，可用于生長、性別和馴食等重要性狀的精準鑒定和挖掘利用。芯片技術(shù)參數(shù)優(yōu)良，平均位點檢出率為99.35%，重復(fù)樣本基因型平均一致率為99.51%，與重測序樣本基因型比對平均一致率為99.11%。芯片整體性能優(yōu)良，穩(wěn)定性好，基因型準確度高。

負責(zé)“鱖芯1號”研發(fā)的核心成員包括團隊負責(zé)人孫成飛副研究員、葉星研究員、董浚鍵助理研究員等。更多相關(guān)訊息詳見https://mp.weixin.qq.com/s/j4F_9Uufw9d7mSOGwUmzNQ。

圖1 鱖魚40K cGPS液相育種芯片檢測試劑盒

圖2 鱖魚40K cGPS液相育種芯片標記位點在染色體上的分布

圖3 “鱖芯1號”的檢測效果