日前,中國水產(chǎn)科學(xué)研究院長江水產(chǎn)研究所范玉頂博士為第一作者、曾令兵研究員為通訊作者的研究論文“Identification and genomic characterization of a novel fish reovirus, Hubei grass carp disease reovirus, isolated in 2009 in China”(2013,94:2266-2277)在病毒學(xué)國際權(quán)威期刊《普通病毒學(xué)雜志》(《Journal of General Virology》)刊登。該期刊2012年影響因子為3.127。
論文詳細(xì)介紹了長江所關(guān)于一株新的草魚呼腸孤病毒分離、鑒定的最新研究成果。論文闡述了長江所科研人員在患出血病草魚體內(nèi)分離到了一株新呼腸孤病毒HGDRV (Hubei grass carp disease reovirus, 原名GCRV104),并利用國際先進(jìn)水平的基因組克隆技術(shù)“FLAC技術(shù)”測定了該病毒的全基因組序列。HGDRV 全基因組大小為23706 bp,由11條(S1-S11)分節(jié)段的dsRNA組成,共編碼12種蛋白(S11編碼兩種蛋白),其中7條片段(S1-S6,S8)編碼的蛋白和已知水生呼腸孤病毒同源蛋白的相似性在15–46%之間,而另外4個片段(S7、S9、S10、S11)編碼的蛋白經(jīng)過Blastp檢索沒有發(fā)現(xiàn)同源蛋白。論文還通過全基因組數(shù)據(jù)的比對分析,證實HGDRV不同于任何已分離到的水生呼腸孤病毒,應(yīng)為水生呼腸孤病毒屬(Aquareovirus)的一個新種。
HGDRV基因組自2012年4月公布以來,引起了國內(nèi)外病毒學(xué)家的極大興趣。短短一年時間,中國、美國、加拿大等國的研究人員就引用了HGDRV的基因組數(shù)據(jù)并將文章發(fā)表在《Journal of Virology》、《PLOS ONE》、《Virology Journal》等著名雜志上。同時,HGDRV的分離鑒定也更新了我國草魚呼腸孤病毒基因分型系統(tǒng),使草魚呼腸孤病毒基因分型由原來的兩個型(Ⅰ、Ⅱ)增加到現(xiàn)在的三個型(Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ),而HGDRV是目前Ⅲ型的唯一代表株。此外,范玉頂博士還利用FLAC技術(shù)獲得了另外4株我國不同地區(qū)草魚呼腸孤病毒典型代表株的全基因組序列,使Genbank數(shù)據(jù)庫中可查詢到的水生呼腸孤病毒全基因組序列由原來的6株增加為現(xiàn)在的11株。
由草魚呼腸孤病毒引起的草魚出血病一直是危害我國草魚健康養(yǎng)殖最為嚴(yán)重病毒性疾病。目前,草魚出血病仍無有效的治療藥物,最為有效的辦法是免疫預(yù)防。論文發(fā)現(xiàn)了草魚呼腸孤病毒的新的株型,豐富了水生呼腸孤病毒基因組資源,有利于進(jìn)一步研究病毒的遺傳進(jìn)化、致病機理,同時對研究與開發(fā)具普遍保護(hù)性的廣譜疫苗具有重要的理論意義和應(yīng)用價值。