根據“農業部關于下達2006年基本科研業務費的通知”和我院“關于做好中央級公益性科研院所基本科研業務費專項資金項目組織實施工作的意見”要求，按照《財政部關于印發< 中央級公益性科研院所基本科研業務費專項資金管理辦法(試行)>的通知》和《中國水產科學研究院南海水產研究所中央級公益性科研院所基本科研業務費專項資金項目管理實施細則（試行）》，南海水產研究所完成了2006－2007年基本科研業務費專項資金項目的組織申報、專項學委會評審、擬資助項目公示和所常務會議研究審議等工作。2006－2007年基本科研業務費專項資金擬資助項目共35項，其中擬對“對蝦養殖池塘水環境浮游藻相平衡控制技術研究”、“馬氏珠母貝優良新品種培育和育珠新技術研究”、“人工魚礁對淺海生態系統結構和功能的影響”、“珠江口海域中華白海豚的調查與保護技術研究”、“羅非魚食源性致病微生物預警體系的研究”、“龍須菜高值化加工關鍵技術的研究”、“淺海養殖環境綜合修復技術研究”、“人類活動對大亞灣漁業生態系統的影響與預測”、“雜色鮑和扇貝重大病害及防治技術研究”和“軍曹魚免疫組織cDNA文庫的構建及免疫分子研究”等10個項目進行重點支持，對“基于生態系統水平的南海北部漁業管理策略優化”等4個項目給予引導支持，對“石斑魚神經壞死病毒病的RNAi設計與篩選”等21個項目進行探索研究。

遴選出的擬資助項目代表了學科發展方向，體現了前瞻布局。通過項目實施，將進一步提升南海水產研究所科研持續發展能力，并有望在一些領域取得重要突破和重大發現。