目前墨西哥的漁業(yè)領(lǐng)導(dǎo)機(jī)構(gòu)是農(nóng)業(yè)農(nóng)村畜牧漁業(yè)食品部，該部門(mén)負(fù)責(zé)制定和實(shí)行漁業(yè)發(fā)展計(jì)劃。其它與漁業(yè)直接相關(guān)的兩個(gè)機(jī)構(gòu)是全國(guó)漁業(yè)委員會(huì)和國(guó)家水產(chǎn)研究院。這兩個(gè)機(jī)構(gòu)為漁業(yè)生產(chǎn)提供行政指導(dǎo)和科學(xué)技術(shù)上的支持。

農(nóng)業(yè)農(nóng)村畜牧漁業(yè)食品部包括許多辦公室和執(zhí)行機(jī)構(gòu)。2001年后，該部門(mén)負(fù)責(zé)漁業(yè)水產(chǎn)的立法工作。其主要職能范圍包括：確定適漁地區(qū)和水域，管理魚(yú)種引進(jìn)，推動(dòng)水產(chǎn)業(yè)的發(fā)展。

全國(guó)漁業(yè)水產(chǎn)委員會(huì)成立于2001年，是農(nóng)業(yè)農(nóng)村畜牧漁業(yè)食品部的執(zhí)行機(jī)構(gòu)，負(fù)責(zé)漁業(yè)水生資源的可持續(xù)開(kāi)發(fā)和利用的管理、協(xié)調(diào)和政策實(shí)施。國(guó)家水產(chǎn)研究院也是農(nóng)業(yè)農(nóng)村畜牧漁業(yè)食品部的執(zhí)行機(jī)構(gòu)，主要進(jìn)行水產(chǎn)技術(shù)的科研，并就漁業(yè)資源的保護(hù)、增殖、魚(yú)種的培育等問(wèn)題提出科學(xué)建議，支持漁業(yè)委員會(huì)的工作。國(guó)家水產(chǎn)研究院編制全國(guó)水產(chǎn)圖譜并每年進(jìn)行更新，記載墨西哥境內(nèi)水體中的所有漁業(yè)資源。

農(nóng)業(yè)農(nóng)村畜牧漁業(yè)食品部已經(jīng)編制了部門(mén)計(jì)劃（2001－2006）以實(shí)現(xiàn)漁業(yè)水產(chǎn)資源的可持續(xù)利用，取得最大的經(jīng)濟(jì)和社會(huì)效益；該計(jì)劃還將積極推進(jìn)漁業(yè)水產(chǎn)活動(dòng)的立法工作。